A observação de que seqüências adjacentes a região do MHC humano, especialmente na região telomérica do cromossomo, mostraram sintenia conservada em mamíferos, um alto desequilíbrio de ligação com os genes MHC e a presença de genes com funções na imunidade (serina-proteasa específica do timo - PRSS16, o gene da hemocromatose - HFE) levaram a reformular os limites do MHC e a estendê-lo, ampliando o MHC clássico de 3,6Mb de comprimento a 7,6Mb, no denominado MHC extendido (xMHC).

• No MHC clássico encontram-se 224 locos dos quais se expressam 128 (57%).
• No xMHC mapeiam 421 locos dos quais estima-se que 252 (60%) são transcritos e apresentam ORFs, 30 locos (7%) são transcritos porém não apresentam ORFs e 139 locos (33%) são pseudogenes.
• A região com maior densidade de genes expressos no xMHC (e no genoma humano) é o MHC de classe III que conta com 58 genes (23% de todos os genes expressos no xMHC).

Os dois clusters mais extensos do xMHC são os que incluem os genes das histonas e os dos tRNAs. Os transcritos destes genes são requeridos em grandes quantidades nas células. Na fase S tardia (G2) do ciclo celular, cada célula precisa de 108 moléculas de cada histona. A transcrição de genes de RNA (incluindo os tRNAs) constitui 80% da transcrição em eucariotos.

A co-localização destes clusters junto ao MHC clássico, que também possui uma alta taxa de transcrição, indica que eles estão sob ação de pressão seletiva, maximizando a transcrição.

Referências

Horton R, et al. Gene map of the extended human MHC. Nat Rev Genet, 5(12):889-99, 2004

Lie BA, Thorsby E. Several genes in the extended human MHC contribute to predisposition to autoimmune diseases. Curr Opin Immunol, Oct;17(5):526-31, 2005.