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Novos casos do coronavírus Covid-19 estão sendo confirmados todos os dias, na China e em todo o mundo. Existem milhares de casos (mais de 191.000) ¹ confirmados, a maioria dos quais está na região do Pacífico Ocidental, mas incluem todos os outros continentes. ¹
O Brasil apresenta 529 de casos confirmados da doença, em 20 estados e no DF, num total de 8.819 casos suspeitos. ²
Mas como são identificados os casos Covid-19, considerando principalmente que os sintomas são semelhantes a qualquer outra doença respiratória – coriza, dor de cabeça, tosse seca, dor de garganta e febre – e que certas áreas do mundo estão no meio da temporada de gripe?
E no Brasil, quais as ações estão sendo tomadas para conter o novo coronavírus?
Os coronavírus têm genomas codificados pelo RNA. Portanto, uma PCR padrão não pode ser usada para detectar a presença do vírus. No entanto, com a pequena adição de uma etapa de transcriptase reversa, o genoma viral pode ser detectado. Essa técnica que existe há décadas, chamada RT-PCR, agora está diretamente no meio do surto.
Em 26 de janeiro, a agência reguladora da China, a National Medical Products Administration (NMPA) anunciou a aprovação de quatro novos produtos de detecção de coronavírus.
Neles estão incluídos os kits de RT-qPCR fluorescente, fabricados pela empresa chinesa de sequenciamento do genoma BGI. A BGI não apenas doou os primeiros 10.000 kits para apoiar a resposta em Wuhan, como também enviou dois de seus sequenciadores DNBSEQ-T7, o presidente e cofundador Wang Jian e uma equipe de funcionários para ajudar na resposta de emergência da cidade.
De acordo com o site da empresa, eles criaram “um centro de comando de emergência em Wuhan para mobilizar esforços e expandir a capacidade de fabricação, com funcionários trabalhando o tempo todo para produzir os kits e organizar o armazenamento, transporte e outras logísticas“. A BGI já liberou um total de 40.000 kits para hospitais e centros de controle de doenças na China. Eles observaram que podem produzir cerca de 50.000 kits por dia e ter cerca de 100.000 em estoque.
Outra empresa chinesa, a Liferiver Biotech levou pouco mais de 10 dias para
desenvolver seu kit de detecção do coronavírus, de acordo com reportagem da CGTN, o site oficial da China Global Television Network. Eles observaram que, desde que a sequência genômica do Covid-19 foi publicada em 10 de janeiro, os funcionários da empresa mantiveram um cronograma de 24 horas para desenvolver um kit para eliminar as cepas dos vírus SARS 2003 e Bat-like SARS, fazendo a detecção específica para o novo coronavírus. A Liferiver afirma que seu kit pode detectar a presença do vírus em menos de duas horas, com 100% de precisão, e que sua capacidade de produção pode testar 200.000 pessoas por dia.
Hong Li, PhD, chefe do departamento de serviços de reagentes do departamento de P&D da GenScript – uma empresa com sede na China e nos Estados Unidos – afirma que seu kit testa a presença de quatro genes Covid-19 múltiplos: o O, R , N e E. Típico dos vírus RNA, os coronavírus sofrem mutações com frequência. Detectar vários genes simultaneamente reduz o risco de falta de detecção que pode ocorrer com a variação genômica. Além disso, Li observou que eles podem detectar o vírus muito cedo. No entanto, o kit pode ser usado apenas para fins de pesquisa.
A sequência do Covid-19 analisada no Brasil apresenta diferenças em relação ao genoma identificado em Wuhan, o epicentro da epidemia na China. Essa valiosa informação veio do estudo das pesquisadoras da USP, Ester Cerdeira Sabino e Jaqueline Góes de Jesus que sequenciaram o genoma do novo coronavírus. O sequenciamento foi feito em um dispositivo portátil inovador da startup britânica Oxford Nanopore Technologies. Nesse dispositivo, as moléculas do DNA ou RNA passam por uma membrana de escala nanométrica. Depois que a composição genômica é traduzida, ferramentas de Bioinformática auxiliam a montar o quebra-cabeças da sequência. O trabalho publicado durou surpreendentes dois dias. Sequenciamento identificou genomas diferentes nos dois casos brasileiros de coronavírus. E ambos são diferentes das sequências chinesas.
O estudo contou também com a ajuda de outros pesquisadores do Instituto Adolfo Lutz (IAL), da Universidade de Oxford e do Instituto de Medicina Tropical da Universidade de São Paulo (IMT-USP).
“Ao sequenciar o genoma do vírus, ficamos mais perto de saber a origem da epidemia”, aponta Sabino. Assim, essa grande descoberta ajudará epidemiologistas, virologistas e especialistas em saúde pública a desenvolverem vacinas e testes diagnósticos.
Qualquer paciente brasileiro que apresente sintomas de infecção respiratória, terá amostras coletadas e enviadas para o Laboratório Central do Estado (Lacen). No caso de instituições particulares, a recomendação é fazer o exame em seu próprio laboratório e enviar uma amostra ao Lacen do seu estado.
Tanto o Lacen quanto laboratórios particulares farão um teste molecular por meio da metodologia de PCR em tempo real, que detecta a presença do RNA ou DNA de outros tipos de vírus respiratórios, para o descarte do novo coronavírus.
Caso a amostra do paciente dê negativo para os outros vírus respiratórios, será realizado o diagnóstico laboratorial para detecção do Covid-19 em um dos Centros Nacionais de Influenza. No Brasil, os únicos laboratórios que tem autorização para fazer este teste são: Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ/RJ), Laboratório de Vírus Respiratórios do Instituto Evandro Chagas (IEC/SVS/MS) e o Laboratório de Vírus Respiratórios do Instituto Adolfo Lutz (IAL/SES-SP).
Estes laboratórios comunicam o resultado por e-mail para o Ministério da Saúde e ao Sistema Gerenciador de Ambiente Laboratorial (GAL), que pode ser acessado pelo hospital solicitante do teste para que o tratamento seja feito o mais rápido possível, de forma correta e segura.
¹ Dados de 18 de março: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200301-sitrep-41-covid-19.pdf?sfvrsn=6768306d_2
² Dados de 18 de março: https://www.gazetadopovo.com.br/republica/breves/casos-suspeitos-de-coronavirus-aumentam-de-433-para-488-no-brasil/
Referências:
https://www.genengnews.com/news/detecting-coronavirus-cases-as-outbreak-grows/
http://agencia.fapesp.br/sequenciamento-identifica-genomas-diferentes-nos-dois-casos-brasileiros-de-coronavirus/32655/
https://blog.dbmolecular.com.br/as-brasileiras-que-lideraram-o-sequenciamento-do-novo-coronavirus/
https://portalarquivos2.saude.gov.br/images/pdf/2020/janeiro/28/Boletim-epidemiologico-SVS-28jan20.pdf
https://www.saude.gov.br/saude-de-a-z/coronavirus
https://portalarquivos2.saude.gov.br/images/pdf/2020/fevereiro/11/protocolo-manejo-coronavirus.pdf